Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
GCAP28676 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
GCAP28676 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
GCAP28676 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
GCAP28676 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms