Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HLA-DMAP28067 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HLA-DMAP28067 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms