Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CD247P20963 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CD247P20963 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CD247P20963 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CD247P20963 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms