Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CXCL2P19875 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms