Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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PTPRAP18433 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PTPRAP18433 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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