Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NME1P15531 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NME1P15531 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NME1P15531 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms