Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ITGAVP06756 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ITGAVP06756 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms