Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRP01130 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRP01130 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRP01130 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LDLRP01130 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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