Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SNX4O95219 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SNX4O95219 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SNX4O95219 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX4O95219 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX4O95219 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX4O95219 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms