Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBXN7O94888 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms