Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPLO60437 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPLO60437 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPLO60437 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PPLO60437 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms