Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCAO15360 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCAO15360 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms