Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRTO14522 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
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