Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KNDC1-202ENST00000368571 3925 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC012485.1-201ENST00000456601 2509 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 MARVELD2-201ENST00000325631 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00587B1AMM8 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms