Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SDR42E2A6NKP2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SDR42E2A6NKP2 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms