Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms