Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBNO2Q9Y2G9 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBNO2Q9Y2G9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBNO2Q9Y2G9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBNO2Q9Y2G9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SBNO2Q9Y2G9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SBNO2Q9Y2G9 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms