Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNAL1Q9UBT7 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms