Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
REREQ9P2R6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms