Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D2AQ9P2K1 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CC2D2AQ9P2K1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms