Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RRBP1Q9P2E9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms