Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MBD5Q9P267 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MBD5Q9P267 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms