Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SCHIP1Q9P0W5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms