Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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