Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNX15Q9NRS6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms