Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PHF7Q9BWX1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms