Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms