Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
IFT140Q96RY7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms