Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYNGAP1Q96PV0 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms