Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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SAMD8Q96LT4 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SAMD8Q96LT4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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