Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MVB12AQ96EY5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
MVB12AQ96EY5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms