Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SPOCD1Q6ZMY3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms