Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TNS3Q68CZ2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms