Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CEP135Q66GS9 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms