Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM46CQ5VWP2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms