Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CEP350Q5VT06 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms