Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CCDC142Q17RM4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CCDC142Q17RM4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CCDC142Q17RM4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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