Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP2B3Q16720 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms