Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDB1Q16531 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDB1Q16531 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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