Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RPE65Q16518 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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