Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDCD2Q16342 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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