Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NPTX1Q15818 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NPTX1Q15818 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.8 ms