Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TCEA2Q15560 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TCEA2Q15560 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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