Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKIV2LQ15477 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SKIV2LQ15477 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SKIV2LQ15477 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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