Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMD6Q15008 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PSMD6Q15008 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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