Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PCLAFQ15004 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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