Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SSPNQ14714 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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