Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SEMA3AQ14563 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms