Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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GBX1Q14549 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GBX1Q14549 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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