Protein–RNA interactions for Protein: Q14432

PDE3A, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase A, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3AQ14432 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PDE3AQ14432 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms